中医认为黑木耳性平，味甘，具有清肺润肠、滋阴补血、活血化瘀、明目养胃等功效，用于治疗崩漏、痔疮、血痢、贫血及便秘等症状；同时黑木耳所含有的发酵素和植物碱可促进消化道和泌尿道腺体分泌，并协同分泌物催化结石，对胆结石、肾结石等有明显的化解作用。
黑木耳含有蛋白质、脂肪、碳水化合物、纤维素，以及硫胺素、核黄素、尼克酸、胡萝卜素、钙、磷、铁等多种维生素及矿物质，其中尤以铁的含量最为丰富。此外，黑木耳的蛋白质中含有多种氨基酸，其中包括赖氨酸、亮氨酸等人体必需氨基酸。黑木耳含有大量胶质，对消化系统有良好的润滑作用，可以消除肠胃中的残存食物和难以消化的纤维性物质，对无意食下的木渣、沙尘等异物有溶解作用。黑木耳的磷脂是人脑细胞和神经细胞的营养剂，是青少年和脑力劳动者实用而又廉价的脑补品。
